《超级机器人大战·原创世纪》的背景是新西历人类正式开始进出宇宙2世纪但因为2次大型陨石的坠下人们的生活还是维持在21世纪初到了新西历179年第3颗陨石“流星3(メテオ3)”坠落于南太平洋的マーケサズ群岛海面地球连邦政府经过调查发现是由人类未知的技术制造的物体这种地球以外的技术被称为EOT(Extra over technology)地球连邦政府组成了“EOT特别审议会”和“EOTI机关”进行调查然后EOTI机关的代表比安博士发表了研究结果表示地球有被宇宙以外的生命体侵略的危机从此人型机动兵器：Personal Trooper的研究开始了